Внешний облик здания дошел до наших дней со значительными изменениями, а очень ценный интерьер синагоги было полностью уничтожено в 1929 году — во время перепланировки сооружения под семилетнюю школу. Тогда немало известных украинских пам'яткоохоронців, в том числе и профессор Федор Эрнст, сделали все возможное для сохранения ценного резьба — культовых конструкций и вещей: «...бесспорно немалую художественную ценность имеет высокий (в три этажа) „уренкойдеш“ (алтарь), прекрасной резьбы, с традиционными изображениями, „балемер“ (собор)... также интересной работы, с подписью мастера». Прибавлялось, что сохранению подлежит также люстра. Однако, как отметил историк А. Ярмола, городской совет на эти выводы не взвесила и того же года провела перепланировку Белоцерковской синагоги «...с такой скоростью, чтобы поставить памятникоохранные органы перед фактом, которого изменить уже было не возможно».
